Согласно п. 3 ст. 154 НК РФ при реализации имущества, подлежащего учету по стоимости с учетом уплаченного НДС, налоговая база устанавливается как разница между ценой реализуемого имущества, определяемого согласно положениям ст. 40 настоящего Кодекса, с учетом НДС, акцизов (для подакцизных товаров и подакцизного минерального сырья) и без включения налога с продаж и стоимостью реализуемого имущества (остаточной стоимостью с учетом переоценок).

В соответствии с п. 5 ст. 169 НК РФ в счете-фактуре должны быть указаны стоимость товаров за все количество поставляемых (отгруженных) по счету-фактуре товаров без НДС и сумма НДС, предъявляемая покупателю товаров, определяемая исходя из применяемых налоговых ставок.

Учитывая вышеизложенное, при реализации имущества, подлежащего учету по стоимости с учетом НДС, в счете-фактуре следует указывать не налоговую базу по НДС, а фактическую стоимость реализованного имущества и сумму НДС, исчисленную с разницы между ценой реализуемого имущества и его стоимостью (остаточной стоимостью с учетом переоценок).

Согласно п. 2 ст. 171 НК РФ вычетам подлежат суммы НДС, предъявленные налогоплательщику и уплаченные им при приобретении товаров на территории Российской Федерации, в случае использования товаров при осуществлении операций, облагаемых НДС.

Кроме того, в соответствии с п. 1 ст. 172 НК РФ налоговые вычеты производятся на основании счетов-фактур, выставленных продавцами при приобретении налогоплательщиком товаров.

Таким образом, покупатели вышеуказанного имущества должны принимать к вычету суммы НДС, указанные в счете-фактуре.