Для ответа на этот вопрос сначала следует определить, за счет каких денежных средств приобретена вакцина.

Если противогриппозная вакцина приобретена за счет денежных средств, оставшихся в распоряжении организации после уплаты налога на прибыль, то стоимость противогриппозной вакцины можно отнести к средствам, истраченным на медицинское обслуживание сотрудников. В соответствии с п. 10 ст. 217 НК РФ медицинское обслуживание в виде сделанной сотрудникам противогриппозной вакцины не облагается налогом на доходы физических лиц.